“تنوع ژنتیکی انسان ویژه آفریقا نزدیک به CHD1L مرتبط با HIV” توسط Paul J McLaren، Immacolata Porreca و همکاران.
عنوان
تنوع ژنتیکی انسان ویژه آفریقایی نزدیک به CHD1L با بار HIV-1 مرتبط است.
نقل قول اصلی
مک لارن پی، پورکا آی، ایاکونیس جی، موک اچ، موخوپادحیای اس، کاراکوک ای، کریستینلی اس، پومیلا سی، بارتا آی، توربال سی، تاف آر، آنجلینو پی، کیار سی، کارستنسن تی، فاتومو اس، پورتر تی، جارویس آی ، اسکارنس دبلیو، باست آ، دگرتر ام، ساتیا مورتی ام، توف جی، کیم ای، والتر ام، سیمونز ال، بشیرووا، بوچبیندر اس، کارینگتون ام، کوساریزا، دی لوکا ای، گودرت جی، گلدشتاین دی، هاس دی ، هربک جی، جانسون ای، کالیبو پی، کیلمب دبلیو، کرک جی، کوتسترا ان، کرال ای، لامبوت او، لو ام، مالال اس، مارتینز-پیکادو جی، مایر ال، میرو جی، مودلی پی، موتالا ای، مولینز جی , Nam K, Obel N, Pirie F, Plummer F, Poli G, Price M, Rauch A, Theodorou I, Trkola A, Walker B, Winkler C, Zagury J, Montgomery S, Ciuffi A, Hultquist J, Wolinsky S, Dougan G، Lever A، Gurdasani D، Groom H، Sandhu M، Fellay J. تنوع ژنتیکی انسانی خاص آفریقایی در نزدیکی CHD1L مرتبط با بار HIV-1. طبیعت. 2023؛ 620 (7976): 1025-30.
کلید واژه ها
JGM، انسان، رده سلولی، هلیکازهای DNA، پروتئین‌های متصل‌کننده به DNA، تنوع ژنتیکی، عفونت‌های HIV، HIV-1، بار ویروسی، آفریقا، کروموزوم‌ها، انسان، جفت 1، آلل‌ها، RNA، طولانی‌مدت غیرکدکننده، تکثیر ویروسی
اعطا کردن
این تحقیق توسط مرکز کمبریج NIHR BRC برای فنوتیپ سلولی پشتیبانی شد. بودجه دانشکده علوم زیستی EPFL; کمک مالی شورای تحقیقات پزشکی بریتانیا MR/N02043/X؛ موسسه ملی تحقیقات سلامت، بریتانیا (مرکز تحقیقات بیومدیکال کمبریج)، ذخیره آکادمیک بالینی کمبریج؛ بنیاد ملی علوم سوئیس (SNF 310030L_197721)؛ کمک هزینه هسته سنگر (WT206194)؛ و H3ABioNet، توسط صندوق عمومی مؤسسه ملی بهداشت تحت شماره کمک مالی U24HG006941 پشتیبانی می شود. کمک های مالی و قراردادهای مؤسسه ملی بهداشت که از این کار حمایت می کنند عبارتند از: U01 HL146240، U01 HL146201، U01 HL146208، U01 HL146333، P30 AI117943، R01 AI165236، و U54 AI1707. این مطالعه تا حدی توسط پروژه PRIN وزارت دانشگاه ایتالیا 2017TYTWZ3 و توسط وزارت بهداشت ایتالیا RF-2019-12369226 به GPJMM حمایت شده است. (IDIBAPS)، بارسلونا، اسپانیا، در طول 2017-2023. این مطالعه تا حدی در داخل SHCS، با حمایت بنیاد ملی علوم سوئیس (گرنت شماره 201369)، توسط پروژه شماره SHCS تامین شد. 841 و از بنیاد تحقیقات SHCS. داده ها از پنج بیمارستان دانشگاهی سوئیس، دو بیمارستان کانتونی، 15 بیمارستان وابسته و 36 پزشک خصوصی (در فهرست http://www.shcs.ch/180-health-care-providers) جمع آوری شده است. این پروژه تا حدی توسط بودجه فدرال از آزمایشگاه ملی تحقیقات سرطان فردریک، تحت قرارداد شماره. 75N91019D00024 و از برنامه تحقیقات درون دانشگاهی NIH، آزمایشگاه ملی فردریک، مرکز تحقیقات سرطان. محتویات این نشریه لزوماً بیانگر دیدگاه‌ها یا سیاست‌های وزارت بهداشت و خدمات انسانی نیست، همچنین ذکر نام‌های تجاری، محصولات تجاری یا سازمان‌ها به معنای تأیید دولت ایالات متحده نیست. این کار تا حدی توسط IAVI که توسط آژانس توسعه بین‌المللی ایالات متحده (USAID) تامین مالی می‌شود، حمایت شد. فهرست کامل اهداکنندگان IAVI در http://www.iavi.org موجود است. مسئولیت محتویات این مقاله بر عهده نویسندگان است و لزوماً منعکس کننده دیدگاه USAID یا دولت ایالات متحده نیست. JFH جایزه ای از برنامه تحقیقاتی اچ آی وی علوم گیلاد دریافت کرد. بورسیه تحصیلی HG از کالج سیدنی ساسکس، کمبریج است. SF توسط Wellcome Trust پشتیبانی می شود (با شماره 220740/Z/20/Z)
خلاصه
HIV-1 همچنان یک بحران بهداشت جهانی است و نیاز به شناسایی اهداف جدید برای درمان را برجسته می کند. در اینجا، با توجه به بار نامتناسب HIV-1 و تنوع مشخص ژنوم انسان در آفریقا، ما عوامل تعیین کننده ژنتیکی کنترل بار ویروسی را در 3879 فرد آفریقایی تبار که با HIV-1 زندگی می کردند و در همکاری ژنومیک بین المللی HIV3 شرکت داشتند، ارزیابی کردیم. . ما یک سیگنال ارتباطی که قبلاً توصیف نشده بود در کروموزوم 1 شناسایی می‌کنیم که در آن واریانت پیک با تقریباً 0.3 نسخه تبدیل‌شده با log10 در هر میلی‌لیتر بار ویروسی مجموعه پایین‌تر در هر کپی آلل جزئی همراه است و مخصوص جمعیت‌های آفریقایی تبار است. نزدیکترین نوع آن بین ژنی است و بین یک RNA غیر کدکننده طولانی بین ژنی (LINC00624) و ژن کدکننده CHD1L قرار دارد که یک هلیکاز درگیر در تعمیر DNA را کد می کند. سنجش عفونت در ماکروفاژهای سلولی iPS و سایر رده‌های سلولی جاودانه افزایش تکثیر HIV-1 را در سلول‌های CHD1L-knockdown و CHD1L-nockout نشان داد. ما شواهدی از مطالعات ژنتیکی جمعیت ارائه می‌کنیم که نشان می‌دهد تنوع ژنتیکی ویژه آفریقایی نزدیک به CHD1L با تکثیر HIV در داخل بدن مرتبط است. اگرچه مطالعات تجربی نشان می‌دهد که CHD1L می‌تواند عفونت HIV را در برخی از انواع سلول‌ها در شرایط آزمایشگاهی محدود کند، تحقیقات بیشتری برای درک مکانیسم‌های مشاهدات ما، از جمله هرگونه اثرات غیرمستقیم احتمالی CHD1L بر گسترش HIV در داخل بدن، که سلول‌های ما انجام می‌دهند، مورد نیاز است. سنجش های مبتنی بر نمی تواند خلاصه شود.
